拉卡拉POS機刷卡扣取手續費的原因主要有以下幾個方面：

首先，作為支付服務提供商，拉卡拉POS機需要投入大量的人力、物力和財力來維護支付系統的正常運行和安全性。這包括技術研發、設備采購、風險控制、客戶服務等方面的支出。為了保證這些服務的持續提供，拉卡拉需要通過收取一定的手續費來覆蓋這些成本。

其次，拉卡拉POS機手續費也是支付服務提供商盈利的一種方式。支付行業是一個高度競爭的市場，拉卡拉需要通過提供優質的服務和合理的費率來吸引和留住商戶。手續費作為支付服務提供商的主要收入來源之一，有助于保證公司的盈利和持續發展。

此外，拉卡拉POS機手續費的高低也與交易的風險和復雜度有關。不同的交易類型、交易金額、商戶類型等因素都會影響交易的風險和復雜度。為了平衡風險和收益，支付服務提供商通常會對不同類型的交易設定不同的費率。

最后，手續費也是支付服務提供商提供優質服務的一種保障。通過收取一定的手續費，支付服務提供商可以更好地投入資源提升服務質量，為商戶提供更加穩定、安全、高效的支付體驗。

綜上所述，拉卡拉POS機刷卡扣取手續費是支付服務提供商維持運營、盈利發展、控制風險以及提供優質服務的必要手段。商戶在選擇支付服務提供商時，應當綜合考慮費率、服務質量、安全性等因素，選擇最適合自己的支付解決方案。