支付公司的POS機費率之所以不同，主要是由于以下幾個方面的因素影響：

POS機交易規模：不同支付公司處理的交易規模不同，交易量越大，支付公司可以通過規模效應降低成本，因此可能提供更低的費率。

POS機風險控制：支付公司需要承擔一定的風險，包括交易風險和技術安全風險。如果支付公司認為某個商戶或行業的交易風險較高，他們可能會對這些商戶或行業收取較高的費率，以補償潛在的風險。

POS機行業競爭：支付行業競爭激烈，各家支付公司希望通過降低費率來吸引更多的商戶。不同支付公司的市場份額和策略不同，因此他們會根據自身情況制定不同的費率。

提供的增值服務：除了基本的支付功能外，支付公司還可以提供一些增值服務，例如數據分析、營銷推廣等。這些增值服務可能會增加支付公司的成本，從而導致費率的差異。

POS機商戶類型：不同類型的商戶對支付公司的要求和需求也不同。例如，小型零售商戶可能更注重費率的低廉性，而大型企業可能更關心支付公司提供的定制化服務和技術支持。支付公司會根據商戶類型的不同，來調整費率。

POS機合作伙伴關系：支付公司與銀行、第三方機構等合作伙伴之間的關系也會影響費率的制定。合作伙伴可能會對支付公司提供一些優惠政策或者降低成本，從而影響支付公司的費率水平。

總的來說，支付公司POS機費率的差異是由于交易規模、風險控制、行業競爭、增值服務、商戶類型以及合作伙伴關系等多個因素共同作用的結果。商戶在選擇支付公司時應綜合考慮這些因素，并根據自身需求選擇適合的支付合作伙伴。